《英雄传说6：空之轨迹FC》游戏设定在一个名为利贝尔王国的和平国度，并以利用七曜石生产的动力装置“导力器”而闻名于世，不过利贝尔的富庶和平也引起其他国家觊觎，邻国艾瑞维尼亚帝国就不时骚扰利贝尔王国边界希望挑动战争，而玩家扮演的就是隶属於“游击士协会”的游击士艾丝蒂尔、约修亚，为了调停两国的纠纷而踏上旅程，展开波澜壮阔的冒险。

在本作中，玩家将以保护市民安全以及维护地区和平为首要目的，而从事消灭魔兽和防止犯罪等任务为特殊副职业。另外游击士并不归属于特定的国家，他们的行事立场是中立的，而且活动范围广阔，因此在游戏中成为一名游击士是很多孩子们的梦想。